"VS2015 x64 Native Tools Command Prompt" を使って, ある配布されたプログラムをビルドしようとしています.

cd build
qmake
nmake release

というように手順が書かれています．
OpenCVとQtを使用しているようです．
注意点として，OpenCVとQtのbinのフォルダにPATHを通すように設定されていたので，コントロールパネル->システム->詳細設定から環境変数のところで設定しました．

しかし，上記のようにコマンドを実行するとnmakeを実行した際に，
fatal error C1003: Cannot open include file:......
というエラーが多数出てきます．
OpenCVにもQtにもパスが通っていないようです．

これまでXcode，Visual Studioしか使ったことがないので，コマンドラインでincludeやlibraryのパスを設定したことがなく，わかりません．
どうすれば設定できるのでしょうか？
よろしければ教えていただけると幸いです．