iOSのapp開発において結果として
UIAlertControllerを頻繁に使ってしまいました。
（極端な話、Viewを遷移するたびに使うたびに表示）

ウル覚えなのですが、頻繁にUIAlertを使用するアプリはリジェクト
対象だったのではないでしょうか？

iOS Human Interface Guidelines
やネットでざっと探してみたところ、
現在はリジェクト理由にないようですが、
どなたか詳し方がいましたら、アドバイスいただければ幸いです。

＜追記：2015/4/20＞
iOS Human Interface Guidelines
一時ビューに不要なアラートを作成しない。一般に、次のような場合には不要です」
ここの記述に引っかかるのではないかと心配です。