新しく参加した Rails プロジェクトを DockerToolbox で動作させたいと思っています。
Rails のバージョンは 4.0.0 です。

# ...省略 Docker Toolbox のセットアップ...

$ git clone path/to/repository.git project
$ cd project
# gem をインストール
$ bundle --path vendor/bundle
# fig を起動
$ fig up -d
# migration を実行（DBは作成済み）
$ rake db:migrate

上記 rake タスクが失敗してしまいます。
エラー内容は下記のとおりです。

Mysql2::Error: All parts of a PRIMARY KEY must be NOT NULL; if you need NULL in a key, use UNIQUE instead: ...

エラーメッセージで調べると参考の通り、 MySQL のバージョンが 5.7.3 以降の場合、 activerecord の実装が原因で MySQL がエラーを吐くようです。

そこで、MySQL のバージョンを 5.6 系にしようとしたのですが、うまくできません。
fig.yml と mysql の Dockerfile は下記の通りです。

fig.yml

mysql:
  build: ./docker/mysql
  environment:
    - MYSQL_ROOT_PASSWORD=password
  volumes_from:
    - data
  ports:
    - "3306:3306"
data:
  image: centos:centos6
  command: /bin/bash
  volumes:
    - /data
    - /var/lib/mysql

docker/mysql/Dockerfile

FROM mysql:5.6

RUN cp -p /usr/share/zoneinfo/Asia/Tokyo /etc/localtime

ADD config/my.cnf /etc/my.cnf

この状態でこうなります。

$ fig build
$ fig up -d
$ fig ps
# =>             Name                          Command               State                 Ports
# => ---------------------------------------------------------------------------------------------------------
# => app_data_1            /bin/bash                        Exit 0
# => app_mysql_1           /entrypoint.sh mysqld            Exit 1
#

fig logs の結果はこうです。

mysql_1         | mkdir: cannot create directory '': No such file or directory

おそらくここでエラーとなっているのだろう、まではわかったのですが、これから先がどうすれば良いか皆目わかりません。