python3でlxml ElementTree を利用しています。
10000KBサイズ程度のxmlファイルをparseして、
Xpathを利用してノードを抽出しています。

全くコードを変更しないで呼び出しを行っているのですが
正常にデータが取得できる場合とエラーになる場合があります。
エラー内容は、
lxml.etree.XPathEvalError: Invalid expression
となります。

正常にデータを取得できるため、xpathの記述は正常だと思われます。

どのような原因が考えられるでしょうか？

読み込むxmlファイルはローカルPCのフォルダに配置されており、
デスクトップ（Windows）からコマンドプロンプトで対象のpythonファイルを実行しています。