どの時期からかわからないのですが、今まで使えていた PHP on FastCGI for IIS 10 で標記エラーが出るようになりました。よくあるセキュリティ関連も調査しましたが問題なく、上位フォルダからセキュリティを一括上書きも効果ありませんでした。ディスクチェックも済です。
PHP は 5.3 / 5.6 も試しましたが、error_log が書かれないため、なんとなくですが処理が PHP まで届いていない気がします。

また、同じ上位フォルダから新しいフォルダを作成し、そこに PHP を置いたら問題なく動いたため、今は業務上の問題は無くなりましたが、問題のあるフォルダは気になるので調査用として残してあります。他に何か調査できるものはありませんでしょうか?