PHPのPOSTの上限について

PHPプログラミング超初心者です。

勉強を主目的に、とある多数のチェック項目に対する記録をするサイトをcloud9とLaravelを使って作成しているのですが、1000を超えるデータをPOSTで送信できないです。
1001以上ある場合に、1000個までしかデータが送られてないです。(Controller内で、 dd($request); で確認しました)
いろいろ調べてphp.iniファイル内の max_input_vars = 3000 にしましたが、1000個のデータしか遅れてないです。

どのようにしたら1000以上のデータがPOST出来るのか教えていただけないでしょうか
該当箇所のViewは以下のように、チェック項目数分データを取得して、 foreach で表示しています。

@foreach ($evidence as $a_evidence)
 <tr>
@if ($first == true)
<td>{!! Form::select('evidence_type[]',['null'=>'', 'strength'=>'+', 'weakness'=>'-', 'neutral'=>'±'],  $a_evidence->evidence_type, ['class' => 'form-control']) !!}</td>
<?php $first = false; ?>
@endif
<td>{!! Form::textarea('evidence_comment[]', $a_evidence->evidence_comment, ['class' => 'form-control', 'rows' => '2']) !!}</td>
<td>{!! Form::text('evidence_document[]', $a_evidence->evidence_document, ['class' => 'form-control']) !!}</td>
</tr>
@endforeach