MongoDB を amazon-linux 上で動かしていたところ、ディスクフルで起動しなくなりました。

2017-09-25T06:06:23.039+0000 [initandlisten] ERROR: Insufficient free space for journal files
2017-09-25T06:06:23.039+0000 [initandlisten] Please make at least 3379MB available in /var/lib/mongo/journal or use --smallfiles
2017-09-25T06:06:23.039+0000 [initandlisten]
2017-09-25T06:06:23.039+0000 [initandlisten] exception in initAndListen: 15926 Insufficient free space for journals, terminating

ログ的データをためているコレクションが原因なので、これを削除しようと考えたのですが、これを実現する方法はありますでしょうか?

  • サービス自体が起動していない (sudo service mongod start が失敗する) ので、 mongo シェルが使えない状態です。
  • ec2 インスタンスなので、ディスクサイズを拡張してやればいいとは思いますが、それはそれでちょっと面倒だと考えています。
  • オペレーションツールがあって、 mongod を起動せずともコレクションを削除できる、が理想なのですが。。こういったツールはありますでしょうか?

追記:

  • mongodb バージョン: v2.6.12
  • ストレージの変更など: 特に行っていなく、デフォルトの設定