サーバー系の勉強を始めた初心者です。
お力を貸して頂きたくこちらに参りました。
宜しくお願い致します。

ターミナルエミュレータ（主にTeraTermを使用）の使用範囲やその用途について
他のOSやソフトとの区別や用途別の使用目的が曖昧で理解できません。

自分で調べて理解できた範囲ですが、
コンソール（出入力装置）を持たないマイコン(CPU)を持った機器に接続し、
機器ごとのUI(操作ソフト)として順応し、外部から出来ない(内部の)処理設定を行える
ざっくりとですが以上のようなものとして捉えておりました。

先日VMwareを使用する機会があり、
サーバー内のLinux系OSを使うことになりました。
ターミナルエミュレータを使わずともVMware上の画面からコマンド操作ができるので
作業はその範囲で終わると思っていましたが、
先輩社員がLinuxである程度コマンド操作をした後に、
ターミナルエミュレータを使用してコマンド操作をしていました。

不思議に思い、Linux系OSを立ち上げてターミナルエミュレータで使用していたコマンド(命令)操作を行ってみましたが、処理が出来ずにエラーとなって返ってきました。
その後に色々調べたのですが、
各OSごとにコマンド(命令)操作の文言に差異があることまでは分かりました。

しかしながら、VMware上であればOSごとの操作を求められるのは当然なので
わざわざターミナルエミュレータを使用しなくて各OS上でコマンド(命令)操作をすればよいのではないか
と思いました。

ここ数日、色々な文献やWEB検索等で調べつくしましたが
明確な回答が得られず、こちらの力を借りることにいたしました。

コンソールやOSを持っていてターミナルエミュレータ使う使用目的、理由はどういうものなのでしょうか？

ご教示頂ければ幸いです。どうか宜しくお願い致します。