Objectがロックされる原因について

お世話になっております。

値が読み込めるが、書き込めないと言う現象に遭遇しました。コード中の何処で発生しているか分からないため、どうしたら発生するのかが分かれば探せないかと考えております。

私が把握している限り

Object.freeze();
Object.seal();
Object.preventExtensions();

などでロックがかかっているのでは？と疑い Object.isExtensible(); でチェックをかけたのですがtrueが返り変更可能と判断されます。

jQueryを使っているので$.extend(true, {}, object);で無理やりディープコピーして対処しているのですが、事故の元なので根本から解決したいと考えております。

また、このObjectの大本のデータはWeb SQL Databaseから取得しております。

よろしくお願いいたします。