ある org ファイルに対して、 org-narrow-to-subtree を、別々の subtree で実行し、
それを別々のウィンドウで表示したいと思いました。

これを実現するにはどうしたらいいでしょうか。

現状、片一方で narrowing した時点で、もう一方の window でも narrowing されてしまいます。