Eclipseでmavenプロジェクトを更新時にエラーが表示される

Eclipseでmavenプロジェクトを更新時、「Maven構成更新中のエラー 次のプロジェクトのmaven構成を更新できません：ネストできません。ネストを可能にするにはsrcから除外してください。」と表示されます。

対処法として下記3点を実施しました。
１．"http://qiita.com/makito/items/6ee52ba9796a8b3498c8"の情報を参考に対応。
２．srcフォルダにはサブフォルダがいくつかあり、pom.xml上の"uild-helper-maven-plugin"にてサブフォルダ設定済。
３．Javaのビルドパスにサブフォルダの追加設定。

上記対応してもエラーは解消できません。
何か他の対処方法があれば、ご教授頂けますでしょうか？

以上、よろしくお願いいたします。

【補足情報】
フォルダ構造とpom.xmlについて補足しました。
■フォルダ構造について
mavenプロジェクト"eformadm"内のソースフォルダ"src"内に下記サブフォルダが複数存在します。

\\eformadm\src\cycommon
\\eformadm\src\core
\\eformadm\src\web

■pom.xmlについて

<project xmlns="http://maven.apache.org/POM/4.0.0" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="http://maven.apache.org/POM/4.0.0 http://maven.apache.org/xsd/maven-4.0.0.xsd">
  <modelVersion>4.0.0</modelVersion>
  <groupId>eformadm</groupId>
  <artifactId>eformadm</artifactId>
  <version>0.0.1-SNAPSHOT</version>
  <packaging>war</packaging>
  <properties>
    <project.build.sourceEncoding>UTF-8</project.build.sourceEncoding>
  </properties>
  <build>
    <finalName>eformadm</finalName>
    <sourceDirectory>src</sourceDirectory>
    <resources>
      <resource>
        <directory>res/conf</directory>
        <excludes>
          <exclude>**/*.java</exclude>
        </excludes>
      </resource>
      <resource>
        <directory>res/sql</directory>
        <excludes>
          <exclude>**/*.java</exclude>
        </excludes>
      </resource>
    </resources>
    <plugins>
      <plugin>
        <artifactId>maven-compiler-plugin</artifactId>
        <version>3.5.1</version>
        <configuration>
          <source>1.8</source>
          <target>1.8</target>
        </configuration>
      </plugin>
      <plugin>
        <artifactId>maven-war-plugin</artifactId>
        <version>3.0.0</version>
        <configuration>
          <warSourceDirectory>WebContent</warSourceDirectory>
          <webXml>WebContent/WEB-INF/web.xml</webXml>
        </configuration>
      </plugin>
      <plugin>
        <groupId>org.codehaus.mojo</groupId>
        <artifactId>build-helper-maven-plugin</artifactId>
        <version>3.0.0</version>
        <executions>
         <execution>
          <id>add-source</id>
          <phase>generate-sources</phase>
          <goals>
           <goal>add-source</goal>
          </goals>
          <configuration>
           <sources>
            <source>src/cycommon</source>
            <source>src/core</source>
            <source>src/web</source>
           </sources>
          </configuration>
         </execution>
       </executions>
      </plugin>
    </plugins>
  </build>
  <dependencies>
      <dependency>
          <groupId>asm</groupId>
          <artifactId>asm</artifactId>
          <version>3.3.1</version>
      </dependency>
      <dependency>
          <groupId>commons-collections</groupId>
          <artifactId>commons-collections</artifactId>
          <version>3.2.1</version>
      </dependency>
      <dependency>
          <groupId>org.apache.commons</groupId>
          <artifactId>commons-compress</artifactId>
          <version>1.13</version>
      </dependency>
      <dependency>
          <groupId>commons-fileupload</groupId>
          <artifactId>commons-fileupload</artifactId>
          <version>1.3.2</version>
      </dependency>
      <dependency>
          <groupId>commons-io</groupId>
          <artifactId>commons-io</artifactId>
          <version>2.4</version>
      </dependency>
      <dependency>
          <groupId>org.apache.commons</groupId>
          <artifactId>commons-lang3</artifactId>
          <version>3.4</version>
      </dependency>
      <dependency>
          <groupId>commons-logging</groupId>
          <artifactId>commons-logging</artifactId>
          <version>1.1.3</version>
      </dependency>
      <dependency>
          <groupId>org.freemarker</groupId>
          <artifactId>freemarker</artifactId>
          <version>2.3.23</version>
      </dependency>
      <dependency>
          <groupId>org.javassist</groupId>
          <artifactId>javassist</artifactId>
          <version>3.20.0-GA</version>
      </dependency>
      <dependency>
          <groupId>log4j</groupId>
          <artifactId>log4j</artifactId>
          <version>1.2.17</version>
      </dependency>
      <dependency>
          <groupId>org.mybatis</groupId>
          <artifactId>mybatis</artifactId>
          <version>3.3.0</version>
      </dependency>
      <dependency>
          <groupId>org.mybatis</groupId>
          <artifactId>mybatis-spring</artifactId>
          <version>1.2.3</version>
      </dependency>
      <dependency>
          <groupId>ognl</groupId>
          <artifactId>ognl</artifactId>
          <version>3.1.12</version>
      </dependency>
      <dependency>
          <groupId>org.springframework</groupId>
          <artifactId>spring-aop</artifactId>
          <version>4.1.6.RELEASE</version>
      </dependency>
      <dependency>
          <groupId>org.springframework</groupId>
          <artifactId>spring-beans</artifactId>
          <version>4.1.6.RELEASE</version>
      </dependency>
      <dependency>
          <groupId>org.springframework</groupId>
          <artifactId>spring-context</artifactId>
          <version>4.1.6.RELEASE</version>
      </dependency>
      <dependency>
          <groupId>org.springframework</groupId>
          <artifactId>spring-context-support</artifactId>
          <version>4.1.6.RELEASE</version>
      </dependency>
      <dependency>
          <groupId>org.springframework</groupId>
          <artifactId>spring-core</artifactId>
          <version>4.1.6.RELEASE</version>
      </dependency>
      <dependency>
          <groupId>org.springframework</groupId>
          <artifactId>spring-expression</artifactId>
          <version>4.1.6.RELEASE</version>
      </dependency>
      <dependency>
          <groupId>org.springframework</groupId>
          <artifactId>spring-jdbc</artifactId>
          <version>4.1.6.RELEASE</version>
      </dependency>
      <dependency>
          <groupId>org.springframework</groupId>
          <artifactId>spring-tx</artifactId>
          <version>4.1.6.RELEASE</version>
      </dependency>
      <dependency>
          <groupId>org.springframework</groupId>
          <artifactId>spring-web</artifactId>
          <version>4.1.6.RELEASE</version>
      </dependency>
      <dependency>
          <groupId>org.postgresql</groupId>
          <artifactId>postgresql</artifactId>
          <version>42.1.1</version>
      </dependency>
      <dependency>
          <groupId>org.apache.struts</groupId>
          <artifactId>struts2-core</artifactId>
          <version>2.5.10.1</version>
      </dependency>
      <dependency>
          <groupId>javax.servlet</groupId>
          <artifactId>javax.servlet-api</artifactId>
          <version>3.1.0</version>
      </dependency>
      <dependency>
          <groupId>org.apache.tomcat</groupId>
          <artifactId>tomcat-dbcp</artifactId>
          <version>7.0.78</version>
      </dependency>
      <dependency>
          <groupId>org.apache.struts</groupId>
          <artifactId>struts2-spring-plugin</artifactId>
          <version>2.5.10.1</version>
      </dependency>
      <dependency>
          <groupId>org.apache.struts</groupId>
          <artifactId>struts2-json-plugin</artifactId>
          <version>2.5.10.1</version>
      </dependency>
  </dependencies>
</project>