お世話になります。
CentOS6.5(final)のサーバーなのですが、root権限で削除できないファイルがあります。

rm -fR xxxx

というコマンドでは削除できない状態です。
どういうわけかパーミションの設定は変更可能ですが、mv rm などのコマンドが効かない状態です。copyはできます。
（パーミッションだけ変更が可能なので、777にしてみましたがこれでも削除できないです。）
削除したい対象のファイルはjavaのwarファイルなのですが、これは何かしらが実行中で作成できないなどの原因があるのでしょうか。
試しに、サーバー筐体再起動を行いましたが、変化ありませんでした。
SELunuxなどの設定は無効にしております。

他、どのような部分を調査すればよいでしょうか。
よろしくお願いいたします。