Settings.settingsに保存している独自構造体の設定がちょっとしたことで消えるのを回避したい

開発環境

• Windows 10(64bit)
• Visual Studio 2015 Update 3
• C#+WPF

問題が発生する手順

• 次のように独自の構造体を作成
  
• 独自構造体を保存するため、Settings.Designer.csを編集(下記の記述を追加)
  
• ところが、Settings.settingsが編集された場合、上記編集箇所(独自構造体保存ロジック)が吹き飛んでしまう
• 現状ではGitでdiffを取りつつ修正しているが、面倒で仕方ないので何とかしたい

よろしくお願いします。