VirtualHostの設定がおかしくなってしまいました

httpd -Sで確認すると以下のようになっています。

port 80 namevhost example.com (/etc/httpd/conf/example.com.conf:1)
       alias example.net

しかし/etc/httpd/conf/example.com.confには

ServerName www.example.com
ServerAlias example.com

としているのでexample.netになってしまう原因がわかりません。

当然ブラウザからみるとexample.comにアクセスしているのにexample.netが表示されてしまいます。

対応の仕方を教えて下さい。

よろしくお願いします。

環境

Apache